2026年蛋白质设计专题研究报告：资料全景与落地参考（95份）

本专题汇集 95 份围绕「蛋白质设计」的资料，覆盖行业报告、政策原文与案例拆解，适合行业研究、企业方案与投资决策参考。

一、背景与定义

「蛋白质设计」是当前行业研究与产业实践中备受关注的方向。本专题系统汇集 95 份相关资料，覆盖从基础概念、技术原理到行业应用与政策合规的多类形态，可作为研究者与从业者的底层资料合集。

二、资料全景与年份分布

本专题共收录 95 份资料。文档年份分布为：2016年2份、2017年2份、2019年1份、2020年2份、2022年4份、2023年12份、2024年14份、2025年17份、2026年3份，覆盖 2016–2026 年。资料形态以行业报告、白皮书、政策与标准原文、工程手册及案例拆解为主，既包含经典基础资料，也包含最新年度的前沿动态。

三、核心内容与代表资料

在内容组织上，本专题包含「蛋白质设计」等方向。代表性资料包括《ColabDesign 2025 Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space 附件1》、《ColabDesign 2025 Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space》、《2023 MiREx mRNA levels prediction from gene sequence and miRNA target knowledge》、《2023 Chroma - Illuminating protein space with a programmable generative model》、《2023 Chroma 附件 - Illuminating protein space with a programmable generative model》、《联合模型 (TrROS + TrMRF)设计更稳定的蛋白质 Cho 等 - 2025 - Stable de novo protein design via joint conformational landscape and sequence optimization》、《GVP-MSA Learning protein fitness landscapes with deep mutational scanning data from multiple sources 2023》、《2024 TExCNN》、《Enformer》、《Variformer》、《De-novo design of a random protein walker 2025.09.29.677966v2.full》、《PocketGen 2024 Efficient generation of protein pockets with PocketGen》、《2024 PSLM Reeves, S. Zero-shot transfer of protein sequence likelihood models to thermostability prediction》、《2023 cDNA display proteolysis - Mega-scale experimental analysis of protein folding stability in biology and design》、《Zhou 等 - 2024 - 深度学习时代的蛋白质工程 - Protein engineering in the deep learning era》、《1986 Codon usage in yeast cluster analysis clearly differentiates highly and lowly expressed genes》、《Codon_usage_bias》、《TISSUES 2.0 an integrative web resource on mammalian tissue expression》等。这些资料从概念、原理、应用到合规形成了较完整的链条，便于按研究方向精准定位。

四、研究方向与典型应用

基于资料高频关键词「蛋白质设计、蛋白质从头设计、protein、蛋白质适应度预测、design、表位多肽疫苗、sequence、深度学习知识」，本专题可支撑该方向上的趋势研判、数据引用与方案论证；在研究侧提供可引用的行业数据与政策原文，在落地侧提供机构研报与项目案例。

五、使用建议

本专题页面支持按标题关键词检索，输入「蛋白质设计」等主题词即可快速定位相关文档。建议研究者从代表性与时效性兼具的资料入手，企业团队从方案与合规类资料切入。资料由 1C9U.COM 蝶动洞察团队系统采集、人工分类整理并持续维护更新。

六、完整资料目录

本专题全部资料按来源目录整理如下，文末附顶层文件。所有文件名均保留原扩展名，可直接在检索框中复制定位。

蛋白质设计（94 份）

2023 cDNA display proteolysis - Mega-scale experimental analysis of protein folding stability in biology and design.pdf
2024TourSynbio：一个多模态大型模型和代理框架，用于连接文本序列和蛋白质序列，用于蛋白质工程.pdf
2025 LucaOne 具有统一核酸和蛋白质语言的广义生物基础模型.pdf
2025 PeptoneBench Advancing Protein Ensemble Predictions Across the Order–Disorder Continuum.pdf
PyRosetta_Manual.pdf
VCHarness - 2026 Harnessing AI to Build Virtual Cells.pdf
Zhou 等 - 2024 - 深度学习时代的蛋白质工程 - Protein engineering in the deep learning era.pdf
分子对接/2016 Software for molecular docking - a review.pdf
分子对接/Tan 等 - 2023 - GAABind a geometry-aware attention-based network .pdf
基于核酸序列预测蛋白质表达量/2023 MiREx mRNA levels prediction from gene sequence and miRNA target knowledge.pdf
基于核酸序列预测蛋白质表达量/2024 TExCNN.pdf
基于核酸序列预测蛋白质表达量/Enformer.pdf
基于核酸序列预测蛋白质表达量/Variformer.pdf
密码子优化和组织表达/1986 Codon usage in yeast cluster analysis clearly differentiates highly and lowly expressed genes.pdf
密码子优化和组织表达/Codon_usage_bias.pdf
密码子优化和组织表达/TISSUES 2.0 an integrative web resource on mammalian tissue expression.pdf
密码子优化和组织表达/基于差异组织基因表达的新型人类组织特异性密码子及密码子对使用表 TissueCoCoPUTs.pdf
密码子优化和组织表达/新型数据库CancerCoCoPUTs中32种原发性肿瘤类型的密码子及密码子对使用具有独特的特征用于癌症特异性密码子使用.pdf
深度学习知识/2006.10503v3 SE(3)-Transformers.pdf
深度学习知识/2017-Transformer-Attention Is All You Need.pdf
深度学习知识/《深度学习入门：基于Python的理论与实现》高清中文版.pdf
深度学习知识/几何等变图神经网络：综述 2022.pdf
深度学习知识/大模型基础完整版.pdf
深度学习知识/大语言模型超参数入门调参手册 - AI全书.pdf
蛋白质从头设计/2023 Chroma - Illuminating protein space with a programmable generative model.pdf
蛋白质从头设计/2023 Chroma 附件 - Illuminating protein space with a programmable generative model.pdf
蛋白质从头设计/2023_结构修饰提高酶稳定性、活性_黄金莎.pdf
蛋白质从头设计/2024 GeoSeqBuilder - All-Atom Protein Sequence Design Based on Geometric Deep Learning 附件.pdf
蛋白质从头设计/2025 De novo Design of All-atom Biomolecular Interactions with RFdiffusion3附件.pdf
蛋白质从头设计/2025-geoevobuilder文章.pdf
蛋白质从头设计/2025-geoevobuilder文章附件.pdf
蛋白质从头设计/2025.09.18.v1-RFdiffusion3.pdf
蛋白质从头设计/2026 NVIDA Proteina-Complexa.pdf
蛋白质从头设计/ChatNT：一种用于DNA、RNA和蛋白质任务的多模态对话代理 2025.pdf
蛋白质从头设计/ColabDesign 2025 Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space 附件1.pdf
蛋白质从头设计/ColabDesign 2025 Scalable protein design using optimization in a relaxed sequence space.pdf
蛋白质从头设计/Computational evolution of poly(U) polymerase for efficient and controlled RNA oligonucleotide synthesis.pdf
蛋白质从头设计/DPO_pLM 用强化学习指导生成式蛋白质语言模型 2024.pdf
蛋白质从头设计/De-novo design of a random protein walker 2025.09.29.677966v2.full.pdf
蛋白质从头设计/Directed Evolution of Enzymes as Catalysts in Synthetic Organic Chemistry (Englisch).pdf
蛋白质从头设计/ESM3 用语言模型来模拟5亿年的进化 2025.pdf
蛋白质从头设计/EvoDiff 利用进化扩散生成蛋白质 2023.pdf
蛋白质从头设计/GeoSeqBuilder_All-Atom Protein Sequence Design Based on Geometric Deep Learning 2024.pdf
蛋白质从头设计/MAProt 设计折叠更稳定的蛋白质.pdf
蛋白质从头设计/ODesign：用于生物分子相互作用设计的世界模型.pdf
蛋白质从头设计/PocketGen 2024 Efficient generation of protein pockets with PocketGen.pdf
蛋白质从头设计/ProteinMPNN文章-2022.pdf
蛋白质从头设计/ProteinMPNN文章附件2022-supplement-Supp_Methods_and_S1-S9.pdf
蛋白质从头设计/Shanker 等 - 2024 - 基于结构信息语言模型的蛋白质和抗体复合物的无监督进化.pdf
蛋白质从头设计/Wang 等 - 2023 - 智能蛋白质设计和分子表征技术：综述 - Intelligent Protein Design and Molecular Character.pdf
蛋白质从头设计/boltzgen - Toward Universal Binder Design.pdf
蛋白质从头设计/百图生科xTrimoPGLM模型蛋白质大语言模型 2023v5.pdf
蛋白质从头设计/联合模型 (TrROS + TrMRF)设计更稳定的蛋白质 Cho 等 - 2025 - Stable de novo protein design via joint conformational landscape and sequence optimization.pdf
蛋白质从头设计/肽-MHC-I复合物高特异性粘合剂的设计 David Baker团队 2025.pdf
蛋白质从头设计/肽-MHC-I复合物高特异性粘合剂的设计文章附件 David Baker团队 2025.pdf
蛋白质从头设计/融合结构知识的蛋白质预训练模型进展.pdf
蛋白质从头设计/酶工程：从人工设计到人工智能_王雅丽.pdf
蛋白质结构预测/2020 Fabian Fuchs AlphaFold 2 & Equivariance.pdf
蛋白质结构预测/2023 蛋白质结构模型质量评估方法综述.pdf
蛋白质结构预测/2024.Analysis of AlphaMissense data in different protein groups and structural context.pdf
蛋白质结构预测/AF3 Day two - questions and answers.pdf
蛋白质结构预测/Moneta、Yaad、Memora在多个任务上全面超越Transformer 2025.pdf
蛋白质表达水平预测/2025 蛋白表达系统的机理模型和人工智能模型研究进展_杨毅.pdf
蛋白质表达水平预测/Enrich2 分析DMS数据的统计框架.pdf
蛋白质表达水平预测/MPB-EXP - Advanced Science - 2025 - Liu - Effective Gene Expression Prediction and Optimization from Protein Sequences.pdf
蛋白质表达水平预测/Venus-TIGER.pdf
蛋白质适应度预测/2024 PSLM Reeves, S. Zero-shot transfer of protein sequence likelihood models to thermostability prediction.pdf
蛋白质适应度预测/DynaMut2.pdf
蛋白质适应度预测/Experimental illumination of a fitness landscape.pdf
蛋白质适应度预测/GVP-MSA Learning protein fitness landscapes with deep mutational scanning data from multiple sources 2023.pdf
蛋白质适应度预测/MAESTRO.pdf
蛋白质适应度预测/Quan 等 - 2016 - STRUM：基于结构的单点突变后蛋白质稳定性变化的预测.pdf
蛋白质适应度预测/ThermoMPNN 预测蛋白质点突变引起的稳定性变化（ΔΔG）基于ProteinMPNN的蛋白质热稳定性预测 2024.pdf
蛋白质适应度预测/computational-design-of-stable-and-soluble-biocatalysts Supporting Information.pdf
蛋白质适应度预测/computational-design-of-stable-and-soluble-biocatalysts.pdf
蛋白质适应度预测/三种测定蛋白质热稳定性方法的比较_周翠燕.pdf
蛋白质适应度预测/基于氨基酸序列和模拟结构预测蛋白质稳定性的研究进展 2017.pdf
蛋白质适应度预测/基于深度学习的蛋白质热稳定性预测方法研究_李梦妤.pdf
蛋白质适应度预测/基于计算结构蛋白设计提高KGF-2热稳定的方法_易吉辉.pdf
蛋白质适应度预测/蛋白质工程提升糖酶热稳定性研究进展_吴晓怡.pdf
蛋白质适应度预测/蛋白质热稳定性计量技术研究进展_李浩正.pdf
表位多肽疫苗/2019 Development a multi-epitope driven subunit vaccine for immune response reinforcement against Serogroup B of Neisseria meningitidis using comprehensive immunoinformatics approaches.pdf
表位多肽疫苗/2020 An overview of in silico vaccine design against different pathogens and cancer.pdf
表位多肽疫苗/2022 A Systematic Immuno-Informatic Approach to Design a Multiepitope-Based Vaccine Against Emerging Multiple Drug Resistant Serratia marcescens.pdf
表位多肽疫苗/2023 免疫信息学在表位疫苗研发中的应用与研究进展.pdf
表位多肽疫苗/2024 Immunoinformatics approachesin developing a novel multi-epitope chimeric vaccine protective against Saprolegnia parasitica.pdf
表位多肽疫苗/2024_通过机器学习方法预测病毒免疫原性-英文.pdf
表位多肽疫苗/2026 Reverse vaccinology 3.0.pdf
表位多肽疫苗/CN202410254164_一种幽门螺旋杆菌黏附蛋白多表位肽疫苗及其制备方法.pdf
表位多肽疫苗/反向疫苗学技术应用及展望_程晓禾.pdf
表位多肽疫苗/反向疫苗学技术概述——背景和技术路线_郝红云.pdf
表位多肽疫苗/反向疫苗学的理念是否正在逐渐失去吸引力.pdf
表位多肽疫苗/基于免疫信息学的幽门螺杆菌多表位疫苗构建与免疫评价.pdf
表位多肽疫苗/表位疫苗的研究进展.pdf